
L'industrie pharmaceutique a entamé 2026 par un virage stratégique décisif, passant des pilotes d'IA expérimentaux à des investissements d'infrastructure substantiels. Dans une série d'annonces très médiatisées en janvier, les géants du secteur Eli Lilly, GSK et Pfizer ont conclu des partenariats pluriannuels avec des startups d'IA émergentes. Ces collaborations — avec Chai Discovery, Noetik et Boltz, respectivement — marquent une évolution significative dans la découverte de médicaments, en déplaçant l'accent vers des modèles fondamentaux (Foundation Models) capables « d'ingénierie » de la biologie avec une précision déterministe (deterministic) plutôt que par des méthodes probabilistes traditionnelles.
Eli Lilly a conclu une collaboration stratégique avec Chai Discovery, basée à San Francisco, pour accélérer la conception de nouveaux thérapeutiques biologiques. Ce partenariat exploite la plateforme d'IA propriétaire de Chai, en particulier son modèle phare Chai-2, reconnu comme la première plateforme de conception d'anticorps zero-shot (zero-shot antibody design) capable d'atteindre des taux de hits expérimentaux à deux chiffres.
Selon les termes de l'accord, Chai Discovery déploiera sa plateforme d'IA « de pointe » pour soutenir les efforts de découverte de médicaments de Lilly sur plusieurs cibles. Un élément crucial de cet accord est le développement d'un modèle d'IA conçu sur mesure et entraîné exclusivement sur l'immense jeu de données propriétaire de Lilly. Ce modèle personnalisé vise à adapter les capacités génératives (generative) de Chai aux flux de travail de découverte spécifiques de Lilly, compressant efficacement les délais d'identification de candidats-médicaments viables de plusieurs mois à quelques semaines seulement.
« Notre collaboration avec Lilly réunit les forces des deux organisations », a déclaré Josh Meier, CEO de Chai Discovery. Il a souligné que le partenariat va au-delà d'un simple accès au modèle, visant à « repousser les limites de la découverte de médicaments en phase précoce habilitée par l'IA ». L'annonce fait suite au tour de financement de série B réussi de Chai Discovery en décembre 2025, qui a valorisé la société à 1,3 milliard de dollars, soulignant la forte confiance du marché dans leur suite de conception moléculaire générative.
Dans un accord qui souligne l'importance croissante de la biologie spatiale, GSK s'est engagé à investir 50 millions de dollars en capital initial pour s'associer à la biotech native IA Noetik. Cet accord sur cinq ans vise à révolutionner la recherche en oncologie, plus précisément pour le cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) et le cancer colorectal (CRC).
Le cœur de ce partenariat est constitué par les modèles fondamentaux (Foundation Models) OCTO-VC (Virtual Cell). Contrairement aux modèles linguistiques standard appliqués à la biologie, OCTO-VC est un modèle de transcriptomique spatiale (spatial transcriptomics) entraîné par apprentissage auto-supervisé sur probablement le plus grand jeu de données de biologie spatiale en oncologie. Il simule la biologie tumorale humaine en prédisant l'expression génique, les états cellulaires et les interactions tumeur–système immunitaire dans leur contexte de voisinage local.
Kim Branson, responsable mondial de l'IA et de l'apprentissage automatique chez GSK, a noté que l'intégration de ces modèles pourrait approfondir de manière significative la compréhension de la biologie du cancer. « L'approche de Noetik pour générer des données spatiales de haute qualité à grande échelle afin d'entraîner des modèles fondamentaux est novatrice », a déclaré Branson.
Cette collaboration représente un passage vers l'« ingénierie déterministe (deterministic engineering) » des médicaments contre le cancer. En simulant la biologie des patients avec des modèles du monde (world models), GSK vise à s'éloigner de l'approche traditionnelle de l'industrie consistant à multiplier les essais. L'accord comprend non seulement le paiement initial de 50 millions de dollars mais aussi des jalons à court terme et des frais d'abonnement récurrents, validant un nouveau modèle économique pour les biotechs IA axé sur la licence d'infrastructures plutôt que sur le seul développement d'actifs.
Pfizer a annoncé une collaboration stratégique avec Boltz, un laboratoire de recherche appliquée en IA connu pour son éthique open-source. Ce partenariat vise à déployer des modèles fondamentaux biomoléculaires de pointe, comprenant Boltz-2 et BoltzGen, au sein des programmes de découverte préclinique (preclinical) de Pfizer.
La collaboration se distingue par son attention portée à l'infrastructure. Boltz affinera ses modèles fondamentaux open-source en utilisant les vastes données historiques de Pfizer pour créer des modèles exclusifs et haute performance pour la prédiction de structures, l'estimation d'affinité des petites molécules et la conception de biologiques. De manière cruciale, Pfizer conserve la pleine propriété de tout composé découvert via cette initiative.
Les analystes du secteur ont décrit la stratégie de Boltz comme le « Red Hat de la biologie », fournissant un « système d'exploitation » de qualité entreprise pour la découverte de médicaments tout en maintenant un noyau open-source. Gabriele Corso, CEO de Boltz, a souligné que les scientifiques de Pfizer figuraient parmi les premiers adopteurs de leurs outils open-source. « Ce partenariat nous aide à porter notre plateforme à un nouveau niveau en termes de précision, de performance et d'intégration », a déclaré Corso. L'accord a coïncidé avec le tour d'amorçage de 28 millions de dollars de Boltz, signalant un fort soutien des investisseurs à leur approche centrée sur l'infrastructure.
La table suivante résume les aspects clés de ces trois collaborations majeures :
| Company | AI Partner | Primary Focus | Key Technology/Terms |
|---|---|---|---|
| Eli Lilly | Chai Discovery | Biologics & Antibody Design | Chai-2 Model: Zero-shot antibody design. Custom AI: Trained on Lilly’s proprietary data. Goal: Compress discovery from months to weeks. |
| GSK | Noetik | Oncology (NSCLC, CRC) | OCTO-VC: Virtual Cell spatial biology models. Deal: $50M upfront + milestones. Goal: Deterministic engineering of cancer drugs. |
| Pfizer | Boltz | Small Molecules & Biologics | Boltz-2/BoltzGen: Open-source foundation models. Strategy: "Red Hat" model refining public models with private data. Goal: Enhance preclinical decision-making accuracy. |
Ces trois accords, tous annoncés dans un laps de temps de quelques jours, illustrent une tendance plus large pour 2026 : l'industrie pharmaceutique passe d'expérimentations avec l'IA à son intégration en tant qu'infrastructure centrale. L'accent s'est déplacé de la simple automatisation vers le déploiement de modèles fondamentaux (Foundation Models) — des systèmes d'IA à grande échelle entraînés sur d'immenses jeux de données biologiques qui peuvent « comprendre » et simuler les interactions biologiques.
La transition de la découverte probabiliste (scrutinant des millions de composés en espérant un « hit ») vers la conception déterministe (ingénierie d'une molécule pour correspondre à un profil de cible spécifique) promet de réduire considérablement les taux d'échec élevés associés aux essais cliniques. Alors que les investissements dans les plateformes d'IA (AI) devraient croître significativement d'ici 2030, ces partenariats en début d'année donnent le rythme pour une année qui sera probablement définie par la convergence du silicium et de la biologie.